· 使用desmond模拟蛋白后,想对其构象变化进行分析绘制一张自由能面热图。是需要将轨迹的每一帧取出,提取c-alpha笛卡尔坐标,后续根据 [/backcolor]sobereva老师的博文(. ,计 … · 如题,gmx好处是可以选择amber力场,小分子和蛋白可以选择不同力场,跑的不满意还可以继续追加续跑;desmond学术版只能用opls力场,也许有大佬会挂在其它力场但是我不会. , … · 这几天看到了公社有帖子讲到了amber比gromacs模拟速度快的问题emm,我就去在自己的电脑上试着测了一下相关的模拟速度,感觉gromacs-2021版本的gpu版本应该还是要比amber … · 忙活了两天安装了schrodinger maestro 2021. 2 linux x64版本。desmond 运行了34万原子的体系,10a cut off,其他都是缺省。速度达到70 ns/day,对比同样硬件(11900kf ,. ,计算 … · 请问哈谁知道desmond_maestro windows学术版本在哪里下载?谢谢,计算化学公社 · 计算化学公社[其它程序] 跪求各位大佬帮助啊,desomond跑动力学的stage 5一跑就报错咋解决啊? [复制链接 copy url] · 最初接触分子动力学起已经过了一年,完完全全的一个小白经过自己摸索也有了一些自己的心得。先说一下背景,我们组是纯纯的实验组,可能觉得当前大趋势是结合模拟,因此. ,计算化 … · 如题,gmx跑完蛋白-小分子动力学之后,想用desmond去分析相互作用,涉及到文件格式转化的问题,大佬们有没有比较简单直接的办法呢?功能全的schrodinger应该有一个gromacs2 … · 本人最近想购置一套与sob老师推荐配置相似的台式电脑(高性价比,11400左右)用于计算化学。但对于计算化学fep计算如(gromacs的pyautofep等)存疑,不知道这个软件发展是. , …
Desmond Doss'S Legacy: Beyond The Missing Leg
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